在治療肛門直腸癰疽中，可根據其發病過程中的初起、成膿、潰后三個階段，分別以消、托、補三法治療，這是運用這一治療總則的典型。
中醫內治法一般應用于初起內痔、外痔或年老體弱病人，中后期內外痔兼有其它嚴重疾病的病人(如肝病、腎病、腹部腫瘤等)，或肛裂、肛管直腸周圍膿腫、瘺管發炎期以及一切肛門感染初起者。
其治療方法，可以歸納為消、托、補三大法則，臨床上應根據病情不同而靈活運用。如在治療肛門直腸癰疽中，可根據其發病過程中的初起、成膿、潰后三個階段，分別以消、托、補三法治療，這是運用這一治療總則的典型。
一、內治法的三個總則
1. 消法：
這是用消散的藥物，使初起的肛周癰疽和炎性外痔等得到消散，免受潰膿和切開之苦。此法適用于沒有成膿的肛周癰疽、炎性外痔、血栓外痔和肛裂等病。但具體用法是極其靈活的，因為各種疾病的病因不同，病的性質也各不相同，所以，治療方法也必須因病而異。
如有表邪者宜解表，里實者宜通里，熱毒蘊結者應清熱解毒，寒邪凝結者應溫通，氣滯者要行氣，血瘀者要活血化瘀等。同時，還需根據病人體質的強弱，癰疽所屬的不同經絡，靈活施治。
凡未成膿者，可以內消，即使不能內消，也可移深出淺，轉重為輕;如膿已成，則不可用內消之法，以免養膿為患，毒散不收，血氣受損，膿毒內蘊，反會侵蝕好肉，潰爛后難于收斂。
2. 托法：
這是用補益氣血的藥物，扶助正氣，托毒外泄，以免毒邪內陷。此法適用于肛周膿腫中期，正氣虛弱，毒邪偏盛，不能托毒外透，肛周癰疽外形平塌，根腳散漫，難潰難腐的虛證。如毒氣盛而正氣未衰者，可用透膿的藥物，促其早日泄出膿毒，腫消痛減，以免膿毒旁竄，造成后患。
3. 補法：
這是用補益的藥物，恢復正氣，助養患處新生，使瘡口、瘺口早日愈合。此法適用于老年體虛，氣血虛弱，潰瘍后期，或肛腸疾病術后，熱毒已去，病灶巳除，而精神衰疲，元氣虛弱，膿水清稀，瘡口難斂者，以及便血和脫垂等病人。凡氣血虛弱者，宜補養氣血，凡脾胃虛弱者，宜理脾和胃，凡肝腎不足者，宜補養肝腎等。但在毒邪未盡的時候，切勿早用補法，以免病邪內蘊，久而為患。